MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 49585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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49502	NC_020834	TGGC	2	8	2540437	2540444	0 %	25 %	50 %	25 %	472337773
49503	NC_020834	TGCC	2	8	2540537	2540544	0 %	25 %	25 %	50 %	472337773
49504	NC_020834	TAA	2	6	2540639	2540644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472337773
49505	NC_020834	ACC	2	6	2540655	2540660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472337773
49506	NC_020834	CCG	2	6	2540726	2540731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472337773
49507	NC_020834	CGTC	2	8	2540746	2540753	0 %	25 %	25 %	50 %	472337773
49508	NC_020834	TGCTTT	2	12	2540772	2540783	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	472337773
49509	NC_020834	T	6	6	2540885	2540890	0 %	100 %	0 %	0 %	472337773
49510	NC_020834	TTTA	2	8	2540937	2540944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49511	NC_020834	T	7	7	2540959	2540965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49512	NC_020834	A	6	6	2541003	2541008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49513	NC_020834	TGA	2	6	2541136	2541141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472337774
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49516	NC_020834	ATTT	2	8	2541234	2541241	25 %	75 %	0 %	0 %	472337774
49517	NC_020834	CTG	2	6	2541258	2541263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472337774
49518	NC_020834	TCA	2	6	2541311	2541316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472337774
49519	NC_020834	TACA	2	8	2541385	2541392	50 %	25 %	0 %	25 %	472337774
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49521	NC_020834	TGA	2	6	2541514	2541519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472337774
49522	NC_020834	GAT	2	6	2541538	2541543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472337774
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49524	NC_020834	AGC	2	6	2541556	2541561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472337774
49525	NC_020834	CAAT	2	8	2541599	2541606	50 %	25 %	0 %	25 %	472337774
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49532	NC_020834	AT	3	6	2541869	2541874	50 %	50 %	0 %	0 %	472337774
49533	NC_020834	GAAT	2	8	2541902	2541909	50 %	25 %	25 %	0 %	472337774
49534	NC_020834	GCC	2	6	2541940	2541945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472337774
49535	NC_020834	GAT	2	6	2541956	2541961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472337774
49536	NC_020834	CAA	2	6	2541984	2541989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472337774
49537	NC_020834	T	7	7	2541997	2542003	0 %	100 %	0 %	0 %	472337774
49538	NC_020834	TAT	2	6	2542071	2542076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472337774
49539	NC_020834	TAA	3	9	2542125	2542133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49540	NC_020834	AAT	2	6	2542137	2542142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49544	NC_020834	A	6	6	2542645	2542650	100 %	0 %	0 %	0 %	472337775
49545	NC_020834	T	6	6	2542661	2542666	0 %	100 %	0 %	0 %	472337775
49546	NC_020834	TCA	2	6	2542693	2542698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472337775
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49584	NC_020834	GCA	2	6	2544620	2544625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49585	NC_020834	A	6	6	2544627	2544632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.